Ühendus Isade Eest sai asutatud 2006 aastal, kahe aktiivse eesti mehe poolt. Asutajaliikmed  olid Urmas Pardane ja Kaido Kallikorm. Põhjused olid nii isiklikud kui üldine vajadus sellise organisatsiooni järele.

Asutamise hetkel oli kogu seadusandja rõhk asetatud elatisest eemale hoidvate isade ohjamisele. Kahjuks olid kaitseta jäätud isad, kellel seadusevastaselt takistati oma lastega kohtuda. Vähesed artiklid, mis üksikisadest rääkisid, viitasid neile kui rongaisadele.

Vastloodud organisatsiooni eesmärgiks oli parandada nende isade elukvaliteeti, kes küll täitsid omi kohustusi, kuid kellele ei olnud tagatud nende õigused. Samuti anda lastele võimalus oma mõlema vanemaga koos üles kasvada.